2014. július 8., kedd. A Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) kutatócsoportja részt vett egy nemzetközi vizsgálatban, amely 518 új, eddig teljesen ismeretlen mikrobaktériumot azonosított az emberi mikrobiótában (bélflóra).
A kutatás, amelyben a tudósok új megközelítést alkalmaztak a bioinformatikai elemzéshez, kibővítette az ismert mikrobiális gének katalógusát is 3-ról 10 millióra.
Ennek a kutatásnak a vasárnap a Nature Biotechnology folyóiratban közzétett eredményei az Európai MetaHIT projekt (Metagenomics Human Intestinal Tract) részét képezik, amelynek 11, 4 millió eurót különítettek el annak vizsgálatára, hogy az emberi mikrobióma hogyan kapcsolódik az egészséghez és a betegséghez . A Vall d'Hebron Intézet de Recerca (VHIR) a projektben 13 résztvevő egyike - és az egyetlen spanyol központ - Dr. Francisco Guarner irányítása alatt, aki kifejtette, hogy nem minden vizsgált minta rendelkezik ezzel. ismeretlen fajok száma.
Egyes egyének bélflórájának mintáiban ezeknek a fajoknak nagyon kevés van, és ha részletesen elemezzük, láttuk, hogy ezek Crohn-kórban szenvedő betegek mintái. "Ez arra utal, hogy ezek a fajok, eddig ismeretlenek, valószínűleg azok, amelyek megkülönböztetik az egészséges emberek és a betegek mikrobiótáját" - jelentette be Guarner.
A kutató szerint ezek az adatok stratégiákat nyitnak e fajok táplálkozási beavatkozással történő helyreállítására: rostok, prebiotikumok beadása, amelyek elősegítik egyes fajok szelektív növekedését, vagy probiotikumok.
Ezek az ismeretlen baktériumok valószínűleg az úgynevezett "jó baktériumok", mivel nem tipikus baktériumok, amelyek fertőzést okoznak, és korábban sem ismertek, sem izoláltak. Guarner szerint a felfedezett baktériumokat nem lehet izolálni, mert "szinte biztosan nem maradnának fenn a kettősponton kívül, hogy átültessék őket".
A VHIR Élettani és Emésztőrendszeri Patofiziológia Csoport munkájáért felelős személy és kutató jelezte, hogy a felfedezett új fajok "nem termeszthetők, nagyon érzékenyek az oxigénre, vagyis nagyon szigorú anaerobok, és nagymértékben függnek környezetétől ahhoz, hogy képesek legyenek túlélni. " "Ugyanezen okból, amikor az adatbázisokba mentünk, nem találtunk nyomot, és eddig semmit sem tudtunk róluk" - mondta Guarner.
A felfedezés a bioinformatikai elemzés új megközelítésének köszönhető, amely lehetővé tette ezeknek a fajoknak a felszínét.
"Jelenleg - Guarner szerint - a szekvenált genetikai anyagnak csak 10% -a ismert 95% -os megbízhatósággal. Ez egy hatalmas szürke területet hagy, amelyen jelenleg dolgoznak."
A tanulmány 741 különféle metagenomikus fajt fedez fel, amelyek nevét annak elkerülhetetlensége miatt nevezték el. Az adatbázisokkal szemben a kutatók azt tapasztalták, hogy e fajok közül 115 már ismert volt, míg 518 ismeretlen; a fennmaradó 108 részlegesen ismert.
"Most már tudjuk, hogy néz ki ezeknek a metagenomikus fajoknak a genomja, de nevek és vezetéknevek nem" - magyarázta Guarner.
Kevés olyan faj nem ismert, amelyek nem ismertek, de nemük vagy a családjuk, amelyhez tartoznak, és a leírtak mintegy 200 metagenomikus faját semmilyen módon nem lehet besorolni, mivel gének több mint 80% -a teljesen ismeretlen ma.
A tudósok szerint az emberekben élő mikroorganizmusok körülbelül 100 milliárd darabot tesznek ki, tízszerese az emberi sejtek teljes számának.
Ugyanezen projekt kezdeti eredményei, 2010-ben, 3 300 000 különféle génre mutattak, 20 000 különféle funkcióra fordítva, amelyek közül 5000 eddig teljesen ismeretlen volt.
Mindegyik embernek körülbelül 600 000 ilyen mikrobiális génje van, és 300 000-et folyamatosan megismételnek az egyének között. "Ebben az új tanulmányban a számot háromszor megszorozzuk, és 9 879 896 különféle gént érünk el" - mondta Guarner.
Forrás:
Címkék:
Étrend-És Táplálkozás Egészség Különböző
A kutatás, amelyben a tudósok új megközelítést alkalmaztak a bioinformatikai elemzéshez, kibővítette az ismert mikrobiális gének katalógusát is 3-ról 10 millióra.
Ennek a kutatásnak a vasárnap a Nature Biotechnology folyóiratban közzétett eredményei az Európai MetaHIT projekt (Metagenomics Human Intestinal Tract) részét képezik, amelynek 11, 4 millió eurót különítettek el annak vizsgálatára, hogy az emberi mikrobióma hogyan kapcsolódik az egészséghez és a betegséghez . A Vall d'Hebron Intézet de Recerca (VHIR) a projektben 13 résztvevő egyike - és az egyetlen spanyol központ - Dr. Francisco Guarner irányítása alatt, aki kifejtette, hogy nem minden vizsgált minta rendelkezik ezzel. ismeretlen fajok száma.
Egyes egyének bélflórájának mintáiban ezeknek a fajoknak nagyon kevés van, és ha részletesen elemezzük, láttuk, hogy ezek Crohn-kórban szenvedő betegek mintái. "Ez arra utal, hogy ezek a fajok, eddig ismeretlenek, valószínűleg azok, amelyek megkülönböztetik az egészséges emberek és a betegek mikrobiótáját" - jelentette be Guarner.
"Jó baktériumok"
A kutató szerint ezek az adatok stratégiákat nyitnak e fajok táplálkozási beavatkozással történő helyreállítására: rostok, prebiotikumok beadása, amelyek elősegítik egyes fajok szelektív növekedését, vagy probiotikumok.
Ezek az ismeretlen baktériumok valószínűleg az úgynevezett "jó baktériumok", mivel nem tipikus baktériumok, amelyek fertőzést okoznak, és korábban sem ismertek, sem izoláltak. Guarner szerint a felfedezett baktériumokat nem lehet izolálni, mert "szinte biztosan nem maradnának fenn a kettősponton kívül, hogy átültessék őket".
A VHIR Élettani és Emésztőrendszeri Patofiziológia Csoport munkájáért felelős személy és kutató jelezte, hogy a felfedezett új fajok "nem termeszthetők, nagyon érzékenyek az oxigénre, vagyis nagyon szigorú anaerobok, és nagymértékben függnek környezetétől ahhoz, hogy képesek legyenek túlélni. " "Ugyanezen okból, amikor az adatbázisokba mentünk, nem találtunk nyomot, és eddig semmit sem tudtunk róluk" - mondta Guarner.
Különböző metagenomikus fajok
A felfedezés a bioinformatikai elemzés új megközelítésének köszönhető, amely lehetővé tette ezeknek a fajoknak a felszínét.
"Jelenleg - Guarner szerint - a szekvenált genetikai anyagnak csak 10% -a ismert 95% -os megbízhatósággal. Ez egy hatalmas szürke területet hagy, amelyen jelenleg dolgoznak."
A tanulmány 741 különféle metagenomikus fajt fedez fel, amelyek nevét annak elkerülhetetlensége miatt nevezték el. Az adatbázisokkal szemben a kutatók azt tapasztalták, hogy e fajok közül 115 már ismert volt, míg 518 ismeretlen; a fennmaradó 108 részlegesen ismert.
"Most már tudjuk, hogy néz ki ezeknek a metagenomikus fajoknak a genomja, de nevek és vezetéknevek nem" - magyarázta Guarner.
Kevés olyan faj nem ismert, amelyek nem ismertek, de nemük vagy a családjuk, amelyhez tartoznak, és a leírtak mintegy 200 metagenomikus faját semmilyen módon nem lehet besorolni, mivel gének több mint 80% -a teljesen ismeretlen ma.
Egy embernek 600 000 mikrobiális génje van
A tudósok szerint az emberekben élő mikroorganizmusok körülbelül 100 milliárd darabot tesznek ki, tízszerese az emberi sejtek teljes számának.
Ugyanezen projekt kezdeti eredményei, 2010-ben, 3 300 000 különféle génre mutattak, 20 000 különféle funkcióra fordítva, amelyek közül 5000 eddig teljesen ismeretlen volt.
Mindegyik embernek körülbelül 600 000 ilyen mikrobiális génje van, és 300 000-et folyamatosan megismételnek az egyének között. "Ebben az új tanulmányban a számot háromszor megszorozzuk, és 9 879 896 különféle gént érünk el" - mondta Guarner.
Forrás:
